«Таким образом» может являться вводным словом означающим следствие, результат. В этом случае оно выделяется запятыми.
Вася часто останавливался отдохнуть. Таким образом, мы пришли домой только к вечеру.
Также фраза «таким образом» может являться членом предложения.
Он взял вёл машину таким образом, что я испугался за свою жизнь.