Голый/Чистый/bare репозиторий в Git — это репозиторий, который не имеет рабочего каталога. Обычно используется в качестве удалённого репозитория. Так как bare репозиторий используется только для обмена, то нет причин создавать рабочую копию на диске, проще говоря, такой репозиторий содержит только каталог .git вашего проекта и ничего больше.